De tweede fase van de werken omvat de oever van de middendijk kant Leopoldkanaal tussen de Zelzatebrug en de uitwateringskokers in Zeebrugge. Deze strook is ongeveer 4 kilometer lang en sluit aan op de eerste fase van de werken die tijdens de zomer van 2023 startte. De volledige herstelling gebeurt gefaseerd en moet in januari 2027 zijn afgerond.

Vooral ter hoogte van de waterlijn is het talud van de dijk afgekalfd. Op de kanaalbodem en de dijkteen worden daarom zinkstukken uit geotextiel met wiepen (wilgentenen) aangebracht. Op de zinkstukken wordt breuksteen en grond gestort. De delen boven de waterlijn worden vervolgens met gras ingezaaid.

Alle werken worden vanaf drijvende pontons op het water uitgevoerd. Tijdens de werken is er bijzondere aandacht voor de stabiliteit van de dijk, waterfluctuaties, stroomsnelheden en het milieu. De verstoring van de dieren en vegetatie op de oever wordt tot een absoluut minimum beperkt.

Na deze fase zal de oever aan de zijde van het Leopoldkanaal volledig zijn hersteld. Dan volgt de zijde aan het Schipdonkkanaal. Alle werken worden uitgevoerd door de nv Herbosch-Kiere in samenwerking met bv Van Aalsburg. Ter hoogte van de werf is de middendijk tijdelijk niet toegankelijk.

Het Afleidingskanaal van de Leie zorgt voor de afvoer van water uit de Leie in Deinze. Het Leopoldkanaal voert het water af van de lokale waterlopen in de polders en het noordelijke deel van het Meetjesland. Het waterpeil (volume) en debiet (stroomsnelheid) van beide kanalen verschilt. De twee kanalen monden naast elkaar uit in zee in de voorhaven van Zeebrugge.